Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usf3B2RUQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usf3B2RUQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usf3B2RUQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms