Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brpf3B2KF05 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brpf3B2KF05 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brpf3B2KF05 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf3B2KF05 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf3B2KF05 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms