Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r232A2RTT5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r232A2RTT5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r232A2RTT5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms