Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1jA2BFR3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1jA2BFR3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1jA2BFR3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms