Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samt1A2BED8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samt1A2BED8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms