Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Upf2A2AT37 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Upf2A2AT37 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Upf2A2AT37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Upf2A2AT37 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Upf2A2AT37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Upf2A2AT37 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Upf2A2AT37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms