Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Camsap1A2AHC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Camsap1A2AHC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Camsap1A2AHC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Camsap1A2AHC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Camsap1A2AHC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.01■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Camsap1A2AHC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Camsap1A2AHC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Camsap1A2AHC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Camsap1A2AHC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Camsap1A2AHC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms