Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc173A0JLY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc173A0JLY1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc173A0JLY1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc173A0JLY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms