Protein–RNA interactions for Protein: A0A1D5RMN0

Tnip3, TNFAIP3-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip3A0A1D5RMN0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnip3A0A1D5RMN0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip3A0A1D5RMN0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip3A0A1D5RMN0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip3A0A1D5RMN0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms