Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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