Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv23A0A0A6YWQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms