Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trbc2A0A075B5J4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbc2A0A075B5J4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbc2A0A075B5J4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trbc2A0A075B5J4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbc2A0A075B5J4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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