Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRTO14522 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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