Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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