Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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