Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN13Q12923 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN13Q12923 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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