Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtl1Q7M732 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms