Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPRTO14522 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRTO14522 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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