Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRTO14522 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms