Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtl1Q7M732 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtl1Q7M732 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms