Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRTO14522 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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