Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRTO14522 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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PTPRTO14522 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRTO14522 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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