Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RDH8Q9NYR8 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 945.2 ms