Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SMAPO00193 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SMAPO00193 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMAPO00193 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMAPO00193 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms