Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRTO14522 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRTO14522 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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PTPRTO14522 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PTPRTO14522 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PTPRTO14522 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRTO14522 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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