Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SMAPO00193 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
SMAPO00193 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
SMAPO00193 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
SMAPO00193 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SMAPO00193 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SMAPO00193 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms