Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRTO14522 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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