Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna3O08545 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms