Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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