Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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