Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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