Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gpc1Q9QZF2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gpc1Q9QZF2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gpc1Q9QZF2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Gpc1Q9QZF2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gpc1Q9QZF2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc1Q9QZF2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gpc1Q9QZF2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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