Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl27Q99N92 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl27Q99N92 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms