Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga1P29974 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms