Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRTO14522 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRTO14522 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PTPRTO14522 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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