Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB2P55268 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB2P55268 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB2P55268 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB2P55268 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB2P55268 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB2P55268 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMB2P55268 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms