Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gpc1Q9QZF2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gpc1Q9QZF2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gpc1Q9QZF2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gpc1Q9QZF2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gpc1Q9QZF2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc1Q9QZF2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gpc1Q9QZF2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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