Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smco4Q9JIS3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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