Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Subh2bvQ9D9Z7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms