Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2surpQ6NV83 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2surpQ6NV83 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms