Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psme1P97371 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme1P97371 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psme1P97371 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms