Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx6Q9ER75 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms