Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms