Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933402E13RikQ9D4D2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms