Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms