Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt71Q9R0H5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt71Q9R0H5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms