Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smco4Q9JIS3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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