Protein–RNA interactions for Protein: Q8R043

Smim29, Uncharacterized protein SMIM29, mousemouse

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Length 75 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim29Q8R043 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim29Q8R043 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim29Q8R043 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim29Q8R043 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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