Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gria4Q9Z2W8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gria4Q9Z2W8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria4Q9Z2W8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria4Q9Z2W8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms