Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clic1Q9Z1Q5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic1Q9Z1Q5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clic1Q9Z1Q5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clic1Q9Z1Q5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clic1Q9Z1Q5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clic1Q9Z1Q5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic1Q9Z1Q5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic1Q9Z1Q5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clic1Q9Z1Q5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms