Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfkbiaQ9Z1E3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbiaQ9Z1E3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfkbiaQ9Z1E3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms